Это миф и неправда. Если загрузить работу в систему Антиплагиат ВУЗ, сам по себе процент ее не поменяется, ни при следующей проверке, ни через длительное время. Однако, если в системе Антиплагиат ВУЗ прикрепить вашу работу и отправить в общую коллекцию, то со временем она проиндексируется и действительно может потерять уникальность.
Так обычно поступают преподаватели, после того как прошла защита дипломов.
В остальных же случая переживать вам не о чем. Вы можете проверять работу сколько угодно.